Les falaises de la Réserve de Scandola, peu accessibles, protègent les nids de nombreux oiseaux dont le Balbuzard l’aigle pêcheur de Scandola, le Cormoran huppé méditerranéen mais aussi l'hirondelle et le martinet, en très grand nombre pour ces deux derniers.  On y trouve aussi le  Puffin cendré, le Faucon pélerin, le Goéland et le Cormoran. On peut également rencontrer, principalement au printemps et en automne, des groupes d'aigrettes faisant escale dans la Réserve lors de leur migration.

Parmi les mammifères marins évoluant dans le Golfe de Porto, on trouve fréquemment le Grand dauphin (présent sur l'ensemble des côtes corses). Plus exceptionnellement, on peut apercevoir le dauphin de Risso, le cachalot ainsi que le rorqual commun qui est le deuxième plus grand cétacé après la baleine bleue.  Les phoques moines, également appelés Veaux Marins, étaient présents en grand nombre en Corse jusqu'à la fin des années 60. Ils ont malheureusement été décimés par les pêcheurs des environs. Un site d'exception porte leur nom au pied du Capo Rosso : la Baie des Veaux Marins.

On aperçoit de manière régulière des chèvres sauvages sur les falaises escarpées de la Réserve de Scandola. Elles sont les descendantes de chèvres domestiquées égarées lors des transhumances des troupeaux.

Dans la famille des reptiles, on rencontre un  peu partout en Corse des lézards, salamandres et geikos. On peut également croiser des tortues marines dans les eaux de la Réserve de Scandola, mais la rencontre reste assez rare…

L'éco-système préservé de Scandola permet à de nombreux scientifiques d’étudier la richesse du monde sous-marin méditerranéen. On peut voir évoluer une multitude poissons, tel que le mérou, l'oblade, le corb, le sar, le loup de méditerranée (bar), et bien d'autres...Lors de la traversée du Golfe de Porto, on peut voir des poissons-lune, qui remontent des grandes profondeurs vers la surface. Des exocets (poissons volants) peuvent s'envoler au passage de l'étrave... La Réserve Naturelle de Scandola est un site exceptionnel pour l’étude des populations de corail rouge, entre autres, car sa protection stricte a permis au corail de se développer pendant plus de 30 ans sans la pression de la pêche et d’atteindre des tailles rarement observées à de faibles profondeurs hors des sites protégés. 

Lors de la visite des falaises des calanques de Piana, du Capo Rosso et de la réserve naturelle de Scandola, depuis le bateau, vous pourrez observer d’étranges tas de branches situés sur le haut des pitons rocheux qui surplombent les eaux translucides. Ce sont les nids du Balbuzard, l’aigle pêcheur de Scandola. Véritable prouesse pour un oiseau, le nid est un volumineux amas de branchages, garni d'écorces, d'herbe et d'autres végétaux. Les plus grands peuvent atteindre 2 mètres de hauteur.

Le Balbuzard, l’aigle pêcheur de Scandola construit son nid sur les pitons rocheux des falaises volcaniques, une sorte de donjon naturel qui lui permet de surveiller le poisson en surface. Il plonge alors à pic, pour attraper son futur déjeuner dans l’eau.

Leur territoire de chasse s'étend sur l'ensemble de la côte Ouest. On peut les voir jusque dans les Calanche de Piana, le Capo Rosso, le Golfe de Porto.

On les aperçoit souvent pendant la visite de la Réserve de Scandola. Le meilleur moment pour admirer ces rapaces est le printemps car les jeunes sont encore dans les nids et les parents se déplacent fréquemment autour des nids pour leur amener de la nourriture.

Depuis le bateau, si votre appareil photo possède un zoom assez puissant, vous pourrez immortaliser ce moment ! On ne peut approcher le Balbuzard, l’aigle pêcheur de Scandola, c’est un oiseau sauvage dans son milieu naturel.

On dénombre aujourd'hui prés d’une trentaine de couples sur l’ensemble de la côte ouest dont une dizaine environ dans la Réserve Naturelle de Scandola

Déclarée espèce protégée, cette population est le résultat d’un soin tout particulier porté à ces oiseaux. Ils sont désormais très nombreux pour ce site et la population ne s'accroîtra plus car la densité est à son maximum. Certains jeunes ont d’ailleurs été transportés dans le Parc de la Maremma, en Toscane, afin de tenter d'y relancer l'espèce. 

C’est toujours un immense bonheur de pouvoir observer le Balbuzard, l’aigle pêcheur de Scandola, lors de nos balades en mer.